Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNPO2Q9UMS6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms