Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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