Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PIGN-226ENST00000638591 2776 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
ZNF479Q96JC4 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms