Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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