Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ZNF501Q96CX3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms