Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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USP13Q92995 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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USP13Q92995 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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