Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GIPC3Q8TF64 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GIPC3Q8TF64 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms