Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms