Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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CLIP4Q8N3C7 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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