Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms