Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SDK2Q58EX2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms