Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COBLL1Q53SF7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms