Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms