Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms