Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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