Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 YWHAE-210ENST00000573026 780 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SNRPD1-204ENST00000582475 723 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 BOLA2P2-202ENST00000604904 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL139317.4-201ENST00000605879 760 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TRIM64FP-201ENST00000427305 1371 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LINC01934-205ENST00000435411 1771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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MKRN4PQ13434 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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MKRN4PQ13434 SNCA-202ENST00000345009 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC019294.1-201ENST00000395215 1184 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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MKRN4PQ13434 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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MKRN4PQ13434 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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MKRN4PQ13434 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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MKRN4PQ13434 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC005154.1-216ENST00000582145 1101 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CU638689.5-201ENST00000623892 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL356585.3-201ENST00000625196 1017 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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