Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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