Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms