Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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