Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FMODQ06828 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms