Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNB3Q05901 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms