Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms