Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
IFITM3Q01628 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms