Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HERVK_113P63121 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms