Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ELLP55199 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ELLP55199 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms