Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HADHBP55084 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HADHBP55084 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HADHBP55084 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms