Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DAP3P51398 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DAP3P51398 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms