Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPFP49454 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPFP49454 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPFP49454 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPFP49454 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPFP49454 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPFP49454 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPFP49454 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPFP49454 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPFP49454 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPFP49454 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPFP49454 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CENPFP49454 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPFP49454 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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