Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TM4SF4P48230 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TM4SF4P48230 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TM4SF4P48230 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TM4SF4P48230 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TM4SF4P48230 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TM4SF4P48230 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TM4SF4P48230 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TM4SF4P48230 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TM4SF4P48230 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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TM4SF4P48230 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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