Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms