Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms