Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMO2P25791 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMO2P25791 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMO2P25791 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms