Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NTF3P20783 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NTF3P20783 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms