Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFE3P19532 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFE3P19532 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TFE3P19532 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms