Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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PTPRAP18433 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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