Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms