Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXTL3O43909 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms