Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms