Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms