Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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