Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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