Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARFGAP3Q9NP61 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms