Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLVAPQ9BX97 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms