Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFT27Q9BW83 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFT27Q9BW83 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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