Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms