Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PLD3Q8IV08 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms