Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms