Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXO38Q6PIJ6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms