Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1038.3 ms