Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HSD17B12Q53GQ0 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms